繼香港中文大學副校長吳樹培上月遭校董會解僱後，校長段崇智周一（8日）提出請辭，於明年1月正式卸任。中大周二（9日）發出公告證實相關消息，指中大校董會主席查逸超周一接獲段崇智的請辭決定。段崇智晚上在保安和職員護送下步出中大行政樓，隨即登上座駕離開，未有回應在場記者高聲提問請辭是出於自願，以及有否受到校董會施壓。
現年72歲的段崇智於2016年加入中大，成為中大傑出訪問教授，並出任組織工程與再生醫學研究所所長，到2017年中獲委任為中大校長。2018年1月，他接替退任的沈祖堯履新，正式出任中大校長，到2022年獲校董會通過續聘多3年，任期至2026年底。
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段崇智剩下12個月任期
公告引述段崇智表示，按照修訂後的大學條例，中大落實新的管治架構，「我認為此時是讓大學物色一位新校長的合適時機」，在未來12個月，將確保大學的管理及運作得以暢順延續及過渡。
中大則感謝段崇智過去6年來盡心服務及領導大學，創立了全港首個「在學．在職計劃」、監督中文大學（深圳）醫學院及音樂學院的成立、帶領中大在世界大學排名中創新高及獲得卓越的研究表現、在內地及國際合作上取得重大進展、以及領導大學的創新創業及可持續發展。
防暴警無視校長在場斡旋擲催淚彈
段崇智在2019年反送中事件中，於中大對開二號橋與學生溝通令中大人印象深刻，他多次應學生要求與示威學生見面，曾聯同大學高層一度前往二號橋與防暴警斡旋，最後在警方施放催淚彈下被護送離開。段崇智數日後發出公開信，指校內大多數並非中大生，形容中大被蒙面示威者佔領，情況完全失控及不可接受；校方經評估風險後，決定提早結束學期，並盡力協助校內師生離開校園。事後，警方聲言一日內在校園檢獲3,900枚汽油彈。段則遭建制派批評「包庇示威者」，並以病假等為由未有就中大相關議題出席立法會會議質詢。
校徽風波引發校董會與管理層決裂
另一宗較受爭議事件則是「校徽風波」。中大生批評段崇智沒有在公開場合交代事件，一直迴避問題。事源中大被指在未經校董會同意下更改校徽，約一星期撤回決定。事件促使新任中大校董會主席查逸超及部份校董，與中大管理層不和的其中一宗標誌性事件。
直至去年底，身兼中大校董的3名立法會議員，包括自由黨張宇人、民建聯劉國勳和工聯會鄧家彪，草擬私人條例草案擬修訂《中大條例》改革校董會組成，指在2019反修例示威期間，中大校方的態度和處理手法有損校譽，嚴重衝擊公眾信任，在校長續任和校徽改動等議題「我行我素」，立法會有責任「撥亂反正」。
改組方案引發校友強烈反對，包括身任校董會秘書的時任副校長吳樹培有份參與聯署，最終私人條例草案去年獲立法會通過。校董會上月中以對吳樹培能以符合良好管治原則的方式，繼續支持校董會工作失去信心為理由，決定即時解僱吳樹培。段崇智事後在網誌公開向吳樹培服務中大16年致謝。
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